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CHAPITRE I
UNE INTRODUCTION AUX TECHNIQUES
DE LA MICROBIOLOGIE
Approvisionnement, culture
et conservation des levures
Introduction
1) Comment se procurer des levures
1-1 Isoler des levures de l’environnement
A partir de végétaux
A partir de drosophiles
A partir de fromages
1-2 Levures d’origine industrielle
Levures lyophilisées
Boulangeries
Pharmacies
1-3 Fournisseurs spécialisés
Institut Pasteur
Sordalab
Sigma
2) Une nécessité : le travail en asepsie
2-1 Règles générales
2-2 Stérilisation des milieux et du matériel
Autocuiseur
Four à microondes
Matériels à usage unique
3) Une approche élémentaire pour obtenir des colonies
4) Repiquage et isolement de colonies
4-1 Repiquage par stries d’épuisement
4-2 Isolement par dilutions en série et étalement
4-3 Technique des répliques
5) Mise en culture dans un milieu liquide et mesure de croissance par turbidimétrie
6) Conservation des souches
6-1 Sur gélose
6-2 En milieu liquide
6-3 Au congélateur
6-4 Envoyer des levures par la Poste
CHAPITRE 2
OBSERVER LES LEVURES AU MICROSCOPE
Techniques cytologiques,
colorations, numération
Introduction
1) Etudier les levures au microscope optique
1-1 Observation vitale sans coloration
1-2 Observations vitales après coloration
Rouge neutre
Vert Janus
1-3 Coloration de frottis fixés
Lugol
Bleu de méthylène
Noir Soudan
Bleu de Nil
2) Mesures diverses sur les cellules
2-1 Dénombrement des cellules avec une lame à numération
2-2 Dimensions des cellules
3) Obtenir des protoplastes
4) Cycle biologique des levures
4-1 reproduction asexuée
Bourgeonnement
Fission
4-2 reproduction sexuée
Fécondation
Sporulation
Coloration des spores sur frottis
5) Etudier les levures au microscope électronique
CHAPITRE 3
EXPERIMENTER SUR LE METABOLISME
ENERGETIQUE
Respiration, fermentation,
contrôle métabolique
Introduction
Méthodes de mesure
1) Mesures sur la respiration
1-1 Précautions et informations
Lavage des levures
Effet Crabtree
Mutants RD
Efficacité des différents sucres
1-2 Mesures avec un microrespiromètre : IR et QR
1-3 Mesures avec une électrode de Clark
Effet de la concentration en substrat
Utilisation respiratoire de divers sucres par S.cerevisiae.
2) Mesures sur la fermentation alcoolique
2-1 Précautions et informations
Lavage des levures
Démarrage d’une fermentation
Précautions
2-2 Manipulation élémentaire
2-3 Comparaison de l’efficacité de différents sucres avec batterie de tubes à essai
2-4 Mesure de l’intensité de fermentation et caractérisation des produits formés.
Caractérisation du gaz produit
Caractérisation de l’éthanol
2-5 Mesure indirecte du volume de gaz dégagé. Effet de l’addition de phosphate.
2-6 Microrespiromètre. Influence de la température.
2-7 Expérimentation assistée par ordinateur
Cinétique de la fermentation (capteur de produits volatils)
Utilisation d’un pH mètre
3) Substrats et métabolisme : méthodes biochimiques
3-1 Détection de la fermentation d’un sucre par un indicateur de pH
Fermentation du maltose
Fermentation du galactose
3-2 Mise en évidence de la respiration par le triphényltétrazolium
3-3 Auxanogrammes
Méthode des disques
Galeries
3-4 Suivi de la consommation de glucose en aérobiose et en anaérobiose avec bandelettes enzymatiques et lecteur
3-5 Transformations métaboliques des sucres : chromatographie sur couche mince
4) Contrôle métabolique
4-1 Mise en évidence de l’effet Crabtree
4-2 Mise en évidence de l’effet Pasteur
4-3 Répression catabolique : manipulation élémentaire
4-4 Répression catabolique : métabolisme du galactose
4-5 Répression catabolique : métabolisme du maltose
5) Cytochromes : spectre d’absorption des cytochromes oxydés et réduits
6) Contenu en ATP de cellules cultivées en aérobiose et en anaérobiose
ANNEXE
Les voies métaboliques de la glycolyse anaérobie et
de la respiration et leur contrôle.
CHAPITRE 4
EXPERIMENTER SUR LES ENZYMES
ET AUTRES PROTEINES
Des biosynthèses
actives
Introduction
1) Détermination du répertoire enzymatique et applications
1-1 Enzymes endogènes et enzymes exportées
1-2 Induction enzymatique
Maltase
Phosphatases
2) Enzymes exportées
2-1 Saccharase : mise en évidence d'une protéine exportée
2-2 Saccharase : cinétique enzymatique
2-3 Catalase
Manipulation élémentaire : mise en évidence de la catalase
Cinétique de la catalase avec une méthode simple
Cinétique de la catalase avec une électrode de Clark
Cinétique de la catalase par colorimétrie
2-4 Phosphatase acide
Mise en évidence de la sécrétion de phosphatase acide
Inhibition de la sécrétion par les phosphates
2-5 Mise en évidence d’une amylase
3) Enzymes intracellulaires
3-1 Maltase
3-2 Succinodéshydrogénase
3-3 Les enzymes de la fermentation : expérience de Büchner
4) Phéromones sexuelles
4-1 Mise en évidence de la sécrétion d’une phéromone sur milieu solide
4-2 Action d’une phéromone in vitro
ANNEXE
Flux de protéines dans les cellules de levures
CHAPITRE 5
EXPLORER LA GENETIQUE DES
LEVURES
Un organisme modèle
en génétique
Introduction
1) Complémentation fonctionnelle
1-1 Test de complémentation fonctionnelle ; dominance et récessivité
1-2 Utiliser la technique des répliques pour déterminer le type sexuel
2) Mutations spontanées
2-1 Mise en évidence de mutants " petite " par la morphologie des colonies
2-2 Mise en évidence de mutants " petite " par le triphényltétrazolium
3) Action du rayonnement ultraviolet sur l’ADN
3-1 Détermination de la DL50
3-2 Mutagenèse par les ultraviolets
3-3 Détermination de la nature des mutations obtenues
4) Interactions entre expression des gènes et environnement
4-1 Nécessité de l’aérobiose pour la synthèse du pigment
4-2 Répression de la biosynthèse de l’adénine par l’adénine
5) Manipulations sur l’ADN
5-1 Extraction de l’ADN génomique
5-2 Extraction de l’ADN plasmidique
5-3 Hydrolyse par enzymes de restriction et électrophorèse sur gel de l’ADN
5-4 Transformation
ANNEXE
Quelques données sur les chromosomes de levure
CHAPITRE 6
PREPARATION DES MILIEUX, REACTIFS
ET SOLUTIONS
Formulaire
1) Milieux de culture
1-1 Préparation des boîtes de culture
1-2 Milieux complets
1-3 Milieu minimum
1-4 Milieu de sporulation
1-5 Milieu sélectif pour la respiration
1-6 Milieu pour l’étude du contrôle métabolique
2) Suppléments
2-1 Antibiotiques
2-2 Acides aminés et bases azotées
2-3 Préparation des rondelles de papier pour auxanogrammes
Sucres
Adénine
3) Colorants cytologiques
3-1 Bleu de méthylène
3-2 Bleu de Nil
3-3 Lugol
3-4 Noir Soudan
3-5 Rouge neutre pour coloration vitale
3-6 Safranine
3-7 Vert janus pour coloration vitale
3-8 Vert malachite
4) Solutions et réactifs divers
4-1 Indicateurs de pH pour révélation de la fermentation
Indicateur au pourpre de bromocrésol
Indicateur au bleu de bromothymol
4-2 Réactif pour la détection des alcools
4-3 Solution pour extraction de plasmides
4-4 Solution de révélation pour chromatographie des sucres
4-5 Solutions pour la transformation
4-6 Solutions pour obtenir des protoplastes
Prétraitement
Traitement
4-7 Solvant de développement pour chromatographie des sucres
4-8 Triphényl tétrazolium (détection de la respiration)
5) Tampons
5-1 Tampon phosphate
5-2 Tampon acide acétique-acétate de sodium
FOURNISSEURS
INDEX
BIBLIOGRAPHIE
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