ENZYMOLOGIE : troisième séance

APPROCHE DES INTERACTIONS ENZYME-SUBSTRAT PAR MODELISATION MOLECULAIRE SUR ORDINATEUR

RETOUR AUX FICHES DE TP
RETOUR AUX ACTIVITES PRATIQUES
    Résultats élèves  (images RASMOL)
    Cliquer sur les images pour obtenir de plus grandes dimensions.

a. Représentation en boules b. Représentation fil de fer
    Substrat en boules
Figure 1 : la carboxypeptidase et son substrat (dipeptide, en rouge)

 
 

Figure 2 : visualisation en ruban de la molécule de carboxypeptidase A

Les différentes structures secondaires sont colorées différemment pour être plus aisément identifiées. On remarque notamment les hélices alpha et les feuillets béta.

Figure 3 : détail du site actif avec un substrat en place
Pour visualiser le complexe enzyme-substrat, seuls le substrat (glycyl-tyrosine) et la partie de la chaîne carbonée de l’enzyme située dans un rayon de 0.6 nanomètres autour du substrat sont représentés. Le squelette protéique est représenté en bâtons tandis que le substrat est représenté en points marquant la surface de la molécule.

TOUS DROITS RESERVES, D. Pol, 1998